Родилась в Скоттсдейле,штат Аризона,в семье домохозяйки и подрядчика.В школьные годы будущая актриса играла в местном молодёжном театре "Valley Youth Theatre".В возрасте пятнадцати лет переехала с матерью в Лос-Анджелес.Стоун начала карьеру на телевидении после утверждения на роль Лори Партридж в ТВ-фильме "Новая семья Партридж"(2005),который включил в себя только один пилотный эпизод.Затем были ещё несколько небольших ролей в сериалах,дебютом же в кино для Эммы стало появление в комедии "Superперцы"(2007).За эту роль она получила премию "Молодой Голливуд"!В следующем году Стоун получила главную роль в фильме "Мальчикам это нравится",она также спела песню для этого фильма "I know What Boys Like",кавер-версию песни 1982 года группы "The Waitresses".В 2010 актриса сыграла главную роль в молодёжной комедии "Отличница легкого поведения" и была номинирована на "Золотой глобус",и ещё на 4 другие премии.Всего она получила 2 награды-"Teen Choice Awards" и "MTV Movie Award".В 2012 году Эмма сыграла в фильме "Новый человек-паук",ей досталась роль Гвен Стейси,девушки Питера Паркера.Вместе с Николасом Кейджом,актриса приняла участие в озвучивании мультфильма "Пещерные люди",который вышел в широкий прокат в марте 2013 года.Стоун также приняла участие в озвучке видео-игры "Sleeping Dogs".
Эмма является натуральной блондинкой.После того,как она получила свою первую роль,актриса перекрасилась в тёмно-русую.Для фильма "Superперцы",она стала рыжей,а для работы в фильме "Новый человек-паук" Стоун вновь стала блондинкой.
В 2009 актриса переехала в Гринвич-Виллидж(самая южная часть Манхэттена).В прошлом увлекалась веб-дизайном и вёрсткой HTML.Дружит с певицей Тейлор Свифт.Встречается с актёром Эндрю Гарфилдом.