Илья Емец родился 21 февраля 1956 года в Воркуте (Россия).
В 1979 году окончил Киевский медицинский институт, лечебный факультет, по специальности- хирургия.
С 1992 года был учредителем клуба Rotary International в Киеве, в котором возглавлял медицинскую гуманитарную программу.
В 1983 году прошел клиническую ординатуру в НИИ Института сердечно-сосудистой хирургии.
С 1993 году Илья Емец получил звание Заслуженного врача Украины.
С 1993 по 1998 год, после получения лицензии на ведение медицинской практики в Австралии, Канаде и Франции работал детским кардиохирургом в главных центрах кардиохирургии этих стран.
В 1997 году защитил кандидатскую диссертацию.
С 1997 года руководит Центром детской кардиохирургии Института сердечно-сосудистой хирургии АМН Украины.
В 1998 году работает штатным кардиохирургом в Hospital J. Cartier (Париж, Франция).
В 2002 году защитил докторскую диссертацию.
В 2003 оду Илья Емец возглавил Научно-практический медицинский центр детской кардиологии и кардиохирургии МЗ Украины.
21 декабря 2010 года назначен Министром здравоохранения Украины в правительстве Николая Азарова.
Илья Емец первым на территории бывшего СССР прооперировал новорождённого с одним из сложнейших пороков сердца – транспозицией магистральных сосудов. Сейчас этому мальчику уже 17 лет.
Илья Емец первым в Украине начал успешно оперировать новорожденных со сложными пороками сердца, внедрять в практику пластические операции на клапанах сердца без использования искусственных протезов.
Илья Емец первым в мире стал использовать пуповинную кровь новорождённого для операций. Зарубежные специалисты уже признали уникальность этого открытия.
Илья Емец автор более 70 научных работ по кардиохирургии.
Женат, растит двух сыновей.